pymol教育版是特定行業開發的三維分子模型設計軟件，軟件提供超級多的小工具去輕松搭建分子模型，便捷的操作，簡單的繪制，自由進行設計，讓你輕松上手開始學習。

pymol官網簡介

PyMOL是一款相當優秀的三維分子模型軟件，使用其集成的光線跟蹤圖形技術，它可以渲染具有更平滑的表面邊界，增強的陰影和反射效果的3D分子結構。軟件支持多種圖像格式，包括PDB，SDF和電子密度圖，便捷的操作方式加上適合于各種不同的操作系統更有強大的兼容里更新以及全面的繪圖等你來加入。

軟件特色

自定義完成對腳本的支持

并且對原來的接口進行取代

而且該軟件的接口可以對TCL、TK的平臺上使用

分布的方式比較的直觀，讓用戶可以清晰的查看到您需要的內容

兼容性比較的強，對各種第三方的插件支持

軟件優勢

借助此分子可視化系統，可以以3D模式對蛋白質，其密度，軌跡和表面進行細微分析

原生視網膜分辨率/ 4k顯示支持

新的APBS插件面板

pymolrc腳本編輯器，突出顯示語法

?？?取消?？坎⒅匦屡帕心承┟姘?生成器，反饋瀏覽器，音量編輯器)

支持觸控板手勢(捏放大/縮小，z旋轉)

用于打開MAE文件，MTZ文件，地圖和軌跡文件的專用對話框

pymol安裝教程

Window系統的pymol運行需要依賴python環境，PMW模塊。

而Pymol的安裝是通過一個python包（Python Wheels）安裝的，因此在開始之前，我們需要根據系統的位數（32位還是64位）以及python的版本來選擇pymol包進行下載。

比方說，系統是windows 64位，系統中有python 3.7（或者打算安裝python 3.7），那么我們就可以有2個選擇，可以選擇下載pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl或者pymol-2.4.0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，對應的版本分別是pymol 2.3和pymol 2.4.

如果有更新的pymol包，可以到這個網址進行查看：https://www.python.org/

安裝python環境

1、如果系統中已經有了python環境，則跳過這一步。可以通過命令行：python –V來查看python的版本號。

2、進入python官網下載windows版的安裝包，網址：https://www.python.org/downloads/

3、注意的是下載的安裝包要和windows系統位數對應，x86對應的是32位系統；x86-64對應的是64位系統，我們就以python 3.7為例，由于我們的系統是64位的，4、所以下載的安裝包為：Windows x86-64 executable installer

5、下載完成后，雙擊進行安裝，記得勾選上Add Python to environment variables，不然后續命令行操作會出現問題。

6、如果安裝成功，Win+R，cmd進入命令行，鍵入python –V就可以看到python的版本號，同時也說明安裝成功。如果報錯“python不是內部或外部命令，也不是可運行的程序或批處理文件。”那么說明python的地址沒有加入環境變量。

安裝PMW

命令行鍵入：python -m pip install pmw

提示說成功安裝pmw，Successfully installed pmw-2.0.1

下載并安裝pymol包

根據系統位數和python版本選擇某個pymol包進行下載，放在某個磁盤根目錄。在這里，我們選擇安裝pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，并放在D:/根目錄。

命令行下，將盤符切換到D:盤，鍵入命令：python -m pip  install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl

提示安裝成功

找到pymol主程序的位置

本文中pymol的主程序地址為：C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe

其中紅色背景部分應該會與不同電腦設置及python版本相一致。